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另一个基因组工具来提高窝产仔数

http://www.zhujiage.com.cn 猪价格网 2018-06-10 11:04 右右 网友评论 |

  窝产仔数是决定盈利能力的一个重要因素。增加窝产仔数的一个主要限制是在妊娠的第2至第3周发生的胚胎丢失(Geisert和Schmitt, 2002, J Anim Sci. 80, E54-E65)。

  许多因素可能导致胚胎丢失,而导致早期胚胎死亡的一个可能原因是必需基因中可能存在一些有害等位基因(一个基因的不同形式),这些等位基因会在母猪怀孕后不久导致胎儿死亡。这些有害等位基因出现的频率可能会在长期选择多产仔数后降低,例如在母系品种中。然而,有些品种并没有选择增加窝产仔数性状(例如杜洛克),这些有害的等位基因可能会被忽略(或隐藏),并且与经过选择的群体相比频率更高。

  通常这些有害的等位基因在纯合状态下会导致胎儿死亡(被称为隐性的,从双亲各自获得1个有害基因的复制,例如aa)。当它们处于杂合状态时(从母亲和父亲继承的等位基因不相同,比如Aa),个体存活下来并且表现为正常。这种被称为载体的杂合动物,很难识别,因此可以继续在群体中传播有害的等位基因。

  基因组技术现在提供了一种最先进的方法来检测这些有害的等位基因,这些等位基因在未选择的种群中相对常见,但在活的动物中不会出现隐性纯合子状态。通过统计分析,该方法仅要求表型正常(即活)个体的基因型数据来检测有害等位基因。该方法最初用于奶牛,检测与生育缺陷相关的等位基因(VanRaden等,2011, J dairy Sci. 94,6153 -6161)。更多近期的研究已经开始在猪身上进行,并在母系和/或商品系中发现一些与更小窝仔数和更多死胎有关的等位基因(Haggman和Uimari, 2017, J Anim Breed Genet. 134, 129-135;Howard等人2017, GSE. 49, 57;Derks等人,2017, BMC Genomics. 18, 858)。

  在加裕基因组数据库中,我们有成千上万头猪的丰富的基因型数据(60K、80K、650K和序列宽),这使我们能够搜索这些与窝产仔数相关的潜在有害等位基因,并通过我们的大量表型集合进一步估计它们对繁殖的影响。我们最初的工作集中在杜洛克公猪身上使用650K SNP基因型。基因组的几个区域被发现可能藏有有害的等位基因。例如,对于最显著的SNP,我们预测应该有45个纯合子隐性(aa)个体,但没有观察到。包含SNP的区域与更多的木乃伊胎显著相关(P < 0.001)。

  与之前在猪身上的报告(见上文)相比,被识别的基因组区域似乎在某种程度上特定于品种或群体中,尽管我们确实看到了一些可能与之前的发现重叠的区域。

  这些发现为潜在增加加裕杜洛克群体的窝产仔数提供了有价值的信息。不仅会引起生产更多的猪,而且还会通过更高的选择强度来提高遗传进展。减少这些有害等位基因频率的方法包括使用加裕自定义SNP芯片的基因组选择和基于基因组的选配计划。

  这些研究成果的实施将对加裕的目标具有重大贡献,即为加裕客户增加价值和盈利能力。

  加裕欢迎张春燕博士

  加裕非常高兴地宣布任命张春燕博士为遗传学家。

  自2010年获得博士学位以来,春燕就职于阿尔伯塔大学(University of Alberta),家畜遗传,Graham Plastow博士项目担任博士后研究员,最近担任研究助理。

  她积极参与了几个研究项目,重点是研究利用基因和基因组方法来改善生产中的重要经济性状。她曾与公司合作,开展行业驱动的研发项目。

  在她的新角色中,春燕将通过整合基因组技术,开发和实施国内外资助的研究项目,重点在于提高猪的遗传改良。作为加裕育种项目团队的一员,她将与其他团队成员和大学人员合作进行研发项目和技术服务。此外,她还将为在中国和亚洲的加裕核心群提供直接监督和支持,并为加裕在中国和亚洲的销售团队提供技术支持。

  “我们期待着春燕为我们的项目做出贡献。我们与她在家畜遗传上合作进行了几个成功的项目。她的技能、经验和参与猪肉行业的愿望使她成为这个职位的最佳人选。我们的基因改良和研发项目继续扩大,并找到合适的人来支持和推动这些项目的发展,这是基因工程和研发未来的关键。” Bob Kemp说道,基因项目研发副总裁

  春燕在华中农业大学获得学士和博士学位。2014年至2016年,她在阿尔伯塔大学获得了Mitacs高级博士后奖学金。她在同行评议的科学期刊上发表了超过20篇文章。

  春燕和丈夫以及两个孩子住在阿尔伯塔省的埃德蒙顿。

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